Ředitelství vodních cest České republiky bylo zřízeno Ministerstvem dopravy a spojů ČR 1.dubna 1998 a je organizační složkou státu zřízenou Ministerstvem dopravy, dle ust. § 51 odst 1., zák. č. 219/2000 Sb. Základním účelem a předmětem činnosti organizační složky státu je:
- zabezpečování podkladů a spolupráce při stanovení parametrů a podmínek výstavby, modernizace, oprav, údržby nebo správy dopravně významných vnitrozemských vodních cest,
- zabezpečení přípravy a realizace nových investic na dopravně významných vnitrozemských vodních cestách sloužících k provozu vodní dopravy na vodních cestách, pokud nejsou součástí a nejedná se o modernizaci existujících vodních děl ve vlastnictví státu, k nimiž mají právo hospodařit státní podniky Povodí,
- výstavba, modernizace, opravy, údržba nebo správa včetně poskytování služeb veřejných přístavů, přístavišť, překladišť, vývazišť, kotvišť, servisních center, speciálních plavidel a dalšího majetku státu tvořící součásti dopravně významných vnitrozemských vodních cest,
- výstavba, modernizace, opravy, údržba a správa majetku ČR užívaného za účelem provozování přístavu ve Spolkové republice Německo ve městě Hamburk, které jsou ve vlastnictví České republiky nebo které má Česká republika v pronájmu,
- výstavba a zajišťování informačních služeb pro správu vodní cesty
- informace a publicita ve věci výstavby, modernizace, oprav, údržby nebo správy dopravně významných vnitrozemských vodních cest.